Lorsque Chloé développe un nouveau super pouvoir destructeur, la Ligue des Héros l'envoie dans un internat d'élite pour super-héros afin d'apprendre à contrôler ses capacités. Confrontés à la perspective de renvoyer Chloé pendant des années, les Thunderman se séparèrent, Phoebe, Barb et Billy l'emmenant se cacher. Max, Hank et Nora traquent les membres voyous de leur famille, jusqu'à ce que les deux factions s'affrontent dans une bataille acharnée pour l'avenir des Thunderman.
